Budowę Dworca Głównego rozpoczęto w 1896 roku. Monumentalny jak na ówczesne czasy, budynek dworcowy oddano do użytku w cztery lata później.
Projekt inspirowany architekturą renesansu obejmował cały zespół dworcowy. Wieża górująca nad budynkiem głównym, jednym z najbardziej charakterystycznych elementów tej części miasta, pełniła rolę wieży ciśnień. Perony były zadaszone.
W 1921 roku zespół dworcowy przeszedł pod zarząd Polskich Kolei Państwowych , pełniąc ważną role w obsłudze ruchu tranzytowego i ochronie interesów Polski w Wolnym Mieście.
W roku 1945 główny budynek dworca został podpalony przez Armię Czerwoną. Mury ocalały i dworzec odbudowano w kształcie bliskim budowli historycznej.
Oryginalnej bryły budowli nie zmieniły również modernizacje w latach 1965 i 1996.
W 2018 roku rozpoczęto remont dworca, co uczyni go jeszcze piękniejszym.